Википедия
Chromatin Interaction Analysis by Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) — молекулярно-биологический метод, позволяющий определять взаимодействия участков хроматина , расположенных на значительном удалении друг от друга в геноме . Такие взаимодействия представляют интерес для определения регуляторных элементов . Регуляторные элементы в клетках могут находиться на значительном расстоянии от промотора регулируемого гена (например, цис-регуляторные элементы , транс-регуляторные элементы , инсуляторы , энхансеры ). Для понимания механизмов таких взаимодействий необходимо знать пространственное расположение участков хроматина друг относительно друга, что этот метод и позволяет определить de novo. В свою очередь, полученная информация важна для понимания механизмов регуляции экспрессии генов .
ChIA-PET основан на применении ChIР , 3С ( Определение конформации хромосом ) и секвенировании спаренных концов , для чего используется высокопроизводительное секвенирование и дальнейшая компьютерная обработка результатов.